حقق المركز الوطني خلال مسيرته القصيرة نسبياً العديد من الإنجازات التي تُحسب له ومنها ما يتعلق بالاتفاقيات والشراكات ومذكرات التفاهم مع جهات محلية وإقليمية ودولية. ففي عام 2007 نظم المركز مؤتمر الإمارات الدولي حول الإدمان.

من جهة ثانية أقام المركز شراكة مع كينجز كولج – لندن من أجل توفير برنامج تدريبي متخصص في مجال الإدمان و علوم العقاقير، ووقع مذكرة تفاهم مع مكتب الأمم المتحدة المعني بالمخدرات والجريمة، وذلك لجعل المركز مرجعاً إقليمياً لتقليص الطلب على المواد المخدرة، كما وقع مذكرة تفاهم ماكلين هارفرد؛ ووفقها يلتزم بتطبيق البرامج العلاجية المطابقة للمعايير الدولية المتبعة في مراكز التميز العالمية المتخصصة في مجال تعاطي المواد المخدرة في مستشفى ماكلين للحصول على الاعتمادية الدولية للمنشآت الصحية، إلى جانب اتفاقية شراكة مع كلية الطب والعلوم الصحية بجامعة الإمارات العربية المتحدة، والتي من خلالها يتم التنسيق والتعاون في تنظيم الملتقيات العلمية وبرامج التدريب والأبحاث العلمية المتخصصة في المجالات الطبية والتأهيل النفسي.

وفي عام 2012 تم توقيع مذكرة تفاهم مع معهد ماتريكس في الولايات المتحدة بهدف توفير خدمات تدريبية وتحقيق رؤية المركز ليصبح معتمداً في تقديم خدمات العيادة الخارجية بناء على نموذج ماتركس.

في عام 2010 تم إفتاح العيادة الخارجية للمرضى الخارجيين والتي شهدت ارتفاعاً ملحوظاً في عدد المراجعين لا سيما وأنها تقدم أفضل الخدمات العلاجية للمرضى وهم يعيشون حياتهم العادية ويمارسون أعمالهم ونشاطاتهم. وخلال العام 2012 تم افتتاح مجمع خليفة للتأهيل الذي يقدم خدماته لمختلف فئات وشرائح المجتمع الإماراتي بأحدث المعدات والأجهزة والمستلزمات الطبية، حيث التزم المركز بتقديم خدمات العلاج والتأهيل بالاعتماد على فريق متعدد التخصصات، وتحت إشراف مجموعة من الخبراء العالميين والمعالجين المتمرسين، مع المراعاة التامة لخصوصية الثقافة الإماراتية والقيم الإسلامية.